在天宇等人会合之后，与此同时，另一边的小光也来到了山梨博士研究所。虽然她在路上迷路了，但很幸运的在半路上碰到了山梨博士，于是小光便直接和山梨博士一起来到研究所。
不过当她和山梨博士进入研究所的时候，里面已经是一片狼藉。此时山梨博士的助手们见山梨博士回来了，顿时被吓的直冒冷汗。
一番询问后才得知，原来是之前小火猴偷吃了波加曼的神奇宝贝食物，气的波加曼对其使出泡沫光线。却不料小火猴翻身躲开后，估计不小心打到了姆克儿和姆克鹰身上。
之后姆克儿和姆克鹰也跟着他们乱来，害的研究所变得一团乱，小火猴和波加曼也趁机跑掉了，现在剩下的新人神奇宝贝只剩草苗龟了。
了解事情的经过后，山梨博士瞪了一眼身旁的助手们，显然山梨博士对他们的表现很不满意，吓得助手们连连道歉。
最终山梨博士也没有真的处罚他们，本来打算让小光在研究所等一会，等他们找到神奇宝贝后再让她挑选新人神奇宝贝。不过这时候小光主动请缨，她想要去帮忙寻找这些神奇宝贝。
“那是可能会成为我伙伴的神奇宝贝，所以我想要去试试。”
山梨博士见小光如此坚定，自然也没有阻止，反而还很欣慰。作为训练家，能够将自己的神奇宝贝放在第一位，这是很难得的品质。
于是在山梨博士的许可下，小光先一步来到后院寻找小火猴和波加曼。
与此同时，天宇等人也即将到达山梨博士的研究所。因为和希罗娜有约的缘故，加上天宇以前也来过神奥地区，所以众人的进度比原着快上不少。
此时小光已经在山梨博士研究所的后院找到了波加曼，在这期间也和波加曼结下了深厚的友谊，同时也在这里的心齐湖见到了三圣菇之一的艾姆利多。
只不过此时的小光还不认识艾姆利多，只以为是什么稀有的神奇宝贝，所以并没有放在心上。
等小光将波加曼找到后，很快姆克鹰也找到了小火猴，小光将他们一并带到山梨博士研究所。
找齐三只神奇宝贝，山梨博士送给了小光一个神奇宝贝图鉴，之后总算可以开始挑选她的初始神奇宝贝了。
“打扰了，山梨博士，好久不见。”
刚好就在这个时候，天宇等人来到了山梨博士研究所，而小光在这之中一眼就看到了天宇。
“啊！你。。。你是那个战胜了米可利的顶级协调训练家，天宇！”
见对方认出了自己，天宇也没有否认，这位应该就是被称为神奥公主的小光。
小光见到天宇点头后便迅速上前与其握手，明显一副小迷妹的样子，惹得小刚十分羡慕。
‘自己刚刚才经历一场失恋，凭什么他就能遇到桃花。’
想到这里，小刚将小光握住天宇手的样子拍了下来，分别发给小遥、小茜等人。等天宇反应过来的时候，已经为时已晚。天宇怎么也没想到，这明明他喜欢的玩法，为什么小刚玩的这么顺手。是不是以为小霞和小胜不在就没人治你了，我期待你收服不良蛙的景象了。
眼看阻拦小刚已经来不及了，天宇也就直接放弃了，和小光握手之后，天宇再次来到山梨博士面前。
“好久不见，山梨博士，这段时间我和我的伙伴会来神奥地区旅行，麻烦您多多关照。”
“客气了，天宇博士，这段时间你的名气也很大啊。可惜你不愿意专注于科研研究，不然你绝对会成为比我和大木都要厉害的研究员。”
天宇和山梨博士闲聊了几句后，这才想起要给小光安排初始神奇宝贝。于是将波加曼、小火猴、草苗龟三只神奇宝贝带到小光面前，由她从中挑选自己的初始神奇宝贝。
对于自己的初始神奇宝贝，小光早就有了选择，那就是已经与她产生牵绊的波加曼。
精灵：波加曼
属性：水
招式：泡沫光线、水枪。。。
等级：10
特性：不服输
资质：冠军
冠军资质的神奇宝贝在外面可以说是万里挑一，大多数训练家的初始神奇宝贝有道馆资质就不错了，但这些主角的初始神奇宝贝就没一个差的。
对此天宇也没有多言，波加曼被选中后十分高兴，小火猴则失落的要石化了，草苗龟一副事不关己的样子，依旧在那里干饭。
选择好初始神奇宝贝后，小光就要踏上属于她的旅程了。不过在她离开山梨博士研究所之前，又有一位客人来到了这里。
“打扰了。”
众人循声望去，来人是一位身穿黑色服饰、留着一头金色长发的美女，正是神奥冠军希罗娜。
见到来人之后，每个人的反应都不一样。
小光是震惊，毕竟对方是神奥冠军，小光自然认识对方，不过没想到能在这里相遇。
小智则是默然，毕竟他不认识对方，要是他知道希罗娜是神奥冠军，那他一定会向她发起挑战。
小刚则是兴奋，毕竟希罗娜可是大美人，再一次发挥他的社交能力向她搭讪。
对于小刚的搭讪，希罗娜只是笑着摇了摇头，表示不约。小刚得到回应后再次心碎，之后希罗娜来到天宇面前和他闲聊起来。
看两人亲密的样子，小刚十分妒忌，再一次拿出手机准备拍照。不过这一次被天宇反应过来，抢先一步抢走手机。开玩笑，和小光这种小女生的合影，天宇还可以用迷妹来解释。要是他们看到自己和希罗娜的照片，那天宇就是跳进河里也解释不清楚了。
在交谈过程中，小智等人也得知了希罗娜的真实身份是神奥地区的冠军，激动的小智果不其然就上前向希罗娜发起了挑战。
对于小智这种勇于挑战的人，希罗娜倒是不讨厌。只不过她这次出来也是有任务的，所以不能停留太多时间，答应对方下次见面的时候，一定会和小智来一场对战。小智听后也是十分兴奋，期待和希罗娜的下一次碰面。
和小智约定好后，希罗娜向山梨博士借了一个没人的房间，因为接下来的话不方便让太多人知道。山梨博士听后点了点头，之后将二人带到一个空房间后便离开了，这时希罗娜总算向天宇说出了这次来找他的真正目的。
“天宇，不知道你有没有听说过银河队这个组织？”