林逸和孙颖解决了神秘组织的危机后，他们的生活看似重归平静，但城市的神秘面纱只是被暂时撩起一角，更多的秘密仍隐藏在黑暗之中。
一天，林逸在整理资料时，发现了一些与废弃大楼装置相似的符号出现在一份古老的文献中。文献记载，这些符号与一个名为“灵界之门”的传说有关，据说每隔百年，灵界与现实世界的界限会变得模糊，而某些特殊的地点和装置可能成为打开灵界之门的钥匙。
与此同时，孙颖在采访中听闻了一系列离奇的失踪案。失踪者都在夜晚经过城市的某个特定区域后消失不见，现场只留下一些奇怪的痕迹，与林逸发现的符号竟有几分相似。两人意识到，新的危机可能正在悄然降临。
他们决定从失踪案入手展开调查。在失踪者最后出现的区域，林逸和孙颖发现了一些微弱的能量波动，这股波动与废弃大楼装置的能量极为相似。顺着线索，他们来到了一座废弃的医院。
医院内弥漫着诡异的气息，灯光闪烁不定。林逸和孙颖小心翼翼地在各个病房中搜寻，突然，他们听到了一阵低沉的呻吟声从地下室传来。当他们赶到地下室时，发现了一个巨大的阵法，阵法上刻满了那些神秘的符号，而阵法中央似乎有什么东西在缓缓苏醒。
就在这时，一群黑影从四面八方涌来。林逸和孙颖与黑影展开了激烈的战斗，在战斗中，他们发现黑影似乎是由某种怨念凝聚而成，普通的攻击对其效果甚微。关键时刻，林逸想起了废弃大楼装置的能量原理，他尝试引导周围的能量，形成了一道防护屏障，暂时挡住了黑影的攻击。
孙颖则在一旁寻找阵法的破绽，她发现阵法的一角有一个能量节点，只要破坏这个节点，或许就能阻止黑影的攻击。林逸看准时机，集中力量冲向能量节点，成功将其破坏。黑影瞬间消散，地下室恢复了平静。
然而，他们还没来得及松口气，就发现阵法中央出现了一道黑色的裂缝，从中传来一股强大的吸力，将林逸和孙颖吸了进去。当他们再次恢复意识时，发现自己来到了一个陌生的世界，这里到处都是奇异的生物和扭曲的建筑，天空中弥漫着黑色的雾气，正是传说中的灵界。
在灵界中，林逸和孙颖遇到了一个自称是灵界守护者的神秘人。神秘人告诉他们，灵界之门被意外打开，一些邪恶的灵体趁机涌入了现实世界，引发了失踪案等一系列危机。而要关闭灵界之门，就必须找到灵界的核心能量源，并将其净化。
林逸和孙颖决定与神秘人合作，他们踏上了寻找灵界核心能量源的旅程。一路上，他们遭遇了各种危险的灵体和陷阱。有能够操控火焰的火灵，还有可以让人陷入幻觉的幻灵。但他们凭借着彼此的默契和勇气，一次次化险为夷。
在经过一片黑暗森林时，他们遇到了一群被困的灵界生物。这些生物告诉林逸和孙颖，森林深处有一个神秘的洞穴，里面藏着能够净化核心能量源的神器。林逸和孙颖毫不犹豫地深入森林，找到了洞穴。洞穴内布满了各种机关和守护灵，但他们没有退缩，成功找到了神器——净化之剑。
拿着净化之剑，他们终于找到了灵界的核心能量源。此时，核心能量源已经被邪恶灵体侵蚀，变得黑暗而扭曲。林逸和孙颖合力挥动净化之剑，释放出强大的净化力量，与邪恶灵体展开了最终的决战。经过一场艰苦的战斗，他们成功净化了核心能量源，灵界之门开始缓缓关闭。
随着灵界之门的关闭，林逸和孙颖回到了现实世界。城市中的失踪案也随之停止，一切似乎又恢复了正常。但他们知道，都市中的神秘传说永远不会停止，而他们将继续守护这座城市，迎接下一次未知的挑战，在神秘与现实的交织中，书写属于他们的传奇故事。