成功追回被盗文物后，柯南等人本以为可以暂时松一口气。然而，在对犯罪组织的后续调查中，他们发现了一个令人震惊的线索。
在犯罪组织的电脑文件里，有一份加密的文档，经过林羽的努力破解，里面的内容让他们倒吸一口凉气。文档中提到了一个名为“黑暗计划”的阴谋，似乎与一种神秘的能量源有关，而这种能量源的线索指向了一个遥远的海岛。
“这个‘黑暗计划’听起来十分危险，我们必须查清楚。”柯南说道。
毛利小五郎皱起眉头：“可是那个海岛位置偏远，情况不明，我们要做好充分的准备。”
灰原哀点头表示同意：“而且这次的对手可能比我们想象的更强大。”
尽管充满了未知和危险，柯南等人还是决定前往海岛一探究竟。他们准备了充足的装备和物资，踏上了新的征程。
到达海岛后，他们发现这里人迹罕至，环境恶劣。岛上布满了茂密的丛林和险峻的山峰，给他们的调查带来了很大的困难。
“大家小心，这里可能隐藏着各种危险。”柯南提醒道。
在探索的过程中，他们遇到了一系列奇怪的事情。有时候会听到诡异的声音从丛林深处传来，有时候会发现一些无法解释的痕迹。
一天，他们在丛林中发现了一个废弃的研究基地。基地里到处都是破旧的仪器和文件，似乎这里曾经进行过某种秘密实验。
毛利兰拿起一份文件，上面的内容让她脸色大变：“这上面说，他们在研究一种可以控制人类思想的能量波。”
“如果这种技术被坏人掌握，后果不堪设想。”林羽说道。
就在这时，基地里突然响起了警报声，一群武装人员冲了进来。
“你们是什么人？竟敢闯入这里！”为首的人大喊道。
柯南等人意识到情况不妙，与武装人员展开了激烈的搏斗。
毛利小五郎凭借着强大的力量，打倒了几个敌人。毛利兰的空手道也发挥了作用，将敌人踢倒在地。
柯南则利用灵活的身法和智慧，寻找敌人的破绽。
林羽和灰原哀则在一旁协助，利用工具和武器干扰敌人。
经过一番激战，他们终于摆脱了敌人的追捕，躲进了一个山洞里。
“这下麻烦了，我们好像触动了什么重要的东西。”毛利小五郎喘着粗气说道。
柯南沉思片刻：“也许这正是我们接近真相的机会。”
在山洞里，他们发现了一些隐藏的通道和密室。在其中一个密室里，他们找到了关于“黑暗计划”的更多线索。
原来，犯罪组织一直在寻找一种神秘的晶体，这种晶体能够释放出强大的能量，用于他们的邪恶计划。
“我们必须找到这种晶体，不能让它落入犯罪组织的手中。”柯南说道。
就在他们准备离开山洞继续寻找晶体的时候，却发现洞口被敌人封锁了。
“看来我们被困住了。”林羽说道。
“别担心，总会有办法的。”柯南安慰道。
他们在山洞里寻找其他出口，却意外地发现了一条通往地下深处的通道。
“也许这是我们的出路。”柯南说道。
他们沿着通道小心翼翼地前进，通道里弥漫着一股难闻的气味，墙壁上闪烁着诡异的光芒。
走着走着，他们来到了一个巨大的地下洞穴。洞穴里有着一池冒着热气的液体，周围的岩石上镶嵌着各种闪闪发光的矿物质。
“这是什么地方？”毛利兰惊讶地问道。
就在这时，洞穴里传来了一阵低沉的咆哮声……