林夜、洛清瑶被时空裂缝吸入一个未知空间后，本以为能解开初代阴谋的更多秘密，然而，沧溟君意识体所在的黑盒突然出现变故，释放出一股诡异的逻辑病毒，瞬间打破了短暂的安宁，一场前所未有的危机就此降临。
黑盒释放的病毒代码如汹涌潮水，以惊人的速度席卷整个空间，将现实世界彻底改写成了像素世界。原本形态各异的生灵，在病毒的侵蚀下，纷纷退化为八位元形态，仿佛从现实世界穿越到了古老的电子游戏之中。林夜低头看向自己的星纹武装，发现它在感染后呈现出游戏装备属性面板，生命值的数字随着他记忆清晰度的波动而不断变化。
“这…… 这到底是怎么回事？” 林夜震惊地看着周围的一切，心中充满了疑惑和恐惧。
洛清瑶同样一脸惊愕：“林夜，似乎是黑盒里的意识体引发了这一切，我们必须尽快找到解决办法，否则整个世界都将被这病毒吞噬。”
就在这时，原始洛清瑶的身影缓缓浮现。她周身环绕着诡异的光芒，已然化身最终 boSS。她的眼神冰冷而空洞，仿佛被某种强大的力量操控。“林夜，这是你最后的考验，也是收割协议的终章。” 原始洛清瑶冷冷地说道。
林夜看着原始洛清瑶，心中五味杂陈。他深知，眼前的她已不再是自己熟悉的清瑶，而是被病毒和收割协议控制的傀儡。战斗一触即发，原始洛清瑶率先发动攻击。她的每个技能都对应着林夜某次轮回的死亡方式，仿佛在无情地揭开他心中的伤疤。
第一个技能 “星神刺目” 发动，一道刺目的光芒瞬间笼罩林夜。在光芒中，林夜仿佛回到了第三千年前的战场。那时，他在一场惨烈的战斗中被敌人的强光刺瞎双眼，最终惨遭杀害。为了击败这个技能，林夜必须重演当时的战场场景，找到破解的方法。
林夜深吸一口气，努力让自己冷静下来。他调动体内的星门能量，试图重现第三千年前的战场。在他的努力下，周围的环境逐渐发生变化，熟悉的战场场景出现在他眼前。林夜凭借着对那次死亡经历的深刻记忆，找到了敌人攻击的破绽，成功破解了 “星神刺目” 技能。
然而，原始洛清瑶的攻击并未就此停止。她接连发动其他技能，每一个技能都让林夜陷入绝境。林夜在攻击中艰难躲避，身上的星纹武装也在不断受损，生命值持续下降。
在激烈的战斗中，林夜发现了病毒代码中隐藏的初代视频日志。日志中，初代那疯狂的声音响起：“清瑶的觉醒意味着收割协议终章…… 林夜，你才是真正的祭品。从一开始，你的每一世轮回都是为了这一刻，为了成为收割协议的完美容器。”
“不！这不可能！” 林夜愤怒地大喊。他一直以为自己是拯救宇宙的关键，却没想到从一开始就被初代当成了棋子。
尽管心中充满愤怒和绝望，林夜并没有放弃。他知道，只有击败原始洛清瑶，才能阻止收割协议的执行，拯救宇宙。
随着战斗的继续，林夜逐渐发现，在这个像素世界里，往生客栈的八位元化投影成为了复活点。柜台老妪也变成了 Npc，向林夜发放星髓任务。完成这些任务，林夜就能获得强大的星髓，提升自己的实力。
林夜一边躲避着原始洛清瑶的攻击，一边完成 Npc 发放的任务。在获得星髓后，他的实力得到了显着提升，逐渐在战斗中占据上风。
当林夜即将击败 boSS 时，原始洛清瑶突然出现数据崩溃的迹象。她的身体开始闪烁，出现一道道裂痕。紧接着，她的身体缓缓展开，展露出体内封印的猩红核心。令林夜震惊的是，这个猩红核心竟是缩小版的收割者本体。
“这…… 这怎么会是收割者本体？” 林夜惊讶地说道。
就在这时，收割者本体发出一阵诡异的笑声：“林夜，你以为你能阻止我？太天真了。清瑶不过是我控制的傀儡，而你，也即将成为我力量的一部分。”
林夜握紧了拳头，眼中燃烧着愤怒的火焰：“收割者，你的阴谋不会得逞的。我一定会摧毁你，拯救清瑶，拯救这个宇宙。”
说完，林夜调动体内所有的力量，朝着收割者本体发动了最后的攻击。在攻击的过程中，林夜发现收割者本体的力量非常强大，每一次攻击都带着毁灭的气息。但林夜没有退缩，他凭借着顽强的意志和对清瑶的爱，一次次化解了收割者的攻击。
就在林夜与收割者激烈对抗时，洛清瑶也加入了战斗。她运用自己独特的力量，干扰收割者的行动，为林夜创造攻击的机会。在两人的默契配合下，收割者的防御逐渐出现破绽。
林夜抓住机会，集中全力朝着收割者本体的核心发动攻击。随着一声巨响，收割者本体被击中，身体开始出现裂痕。“不！这不可能……” 收割者发出一声绝望的怒吼，身体逐渐消散。
随着收割者本体的消散，原始洛清瑶也恢复了意识。她看着林夜，眼中充满了愧疚和感动：“林夜，对不起…… 我被收割者控制了。”
林夜紧紧地抱住洛清瑶：“清瑶，没事了。一切都结束了。”
然而，林夜知道，这场危机虽然暂时解除，但初代的阴谋或许还没有完全终结。宇宙中可能还隐藏着其他危机，他们必须继续保持警惕，守护宇宙的和平。
在接下来的日子里，林夜、洛清瑶开始修复被病毒破坏的世界。他们利用星髓的力量，逐渐恢复了世界的原貌。在这个过程中，他们也对收割协议和初代的阴谋有了更深入的了解。
林夜发现，初代与收割者之间的勾结远比想象中复杂。收割者为了获得宇宙的控制权，与初代达成协议，利用林夜和洛清瑶的轮回，试图培养出完美的容器。而初代则希望借助收割者的力量，实现自己统治宇宙的野心。
“清瑶，我们不能掉以轻心。初代和收割者可能还有其他后手。” 林夜对洛清瑶说道。
洛清瑶点了点头：“我明白。我们必须尽快找到应对的方法，防止类似的危机再次发生。”
就在这时，宇宙中突然传来一股强大的能量波动。林夜和洛清瑶立刻察觉到了异常，他们迅速朝着能量波动的源头飞去。当他们到达目的地时，发现那里出现了一个巨大的时空漩涡。漩涡中散发着神秘的气息，仿佛连接着另一个未知的世界。
“林夜，这是什么地方？” 洛清瑶看着时空漩涡，心中充满了疑惑。
林夜皱了皱眉头：“我也不清楚，但这股能量波动很危险。我们必须小心。”
就在林夜和洛清瑶准备探索时空漩涡时，一群神秘的生物从漩涡中涌出。这些生物身形各异，浑身散发着诡异的光芒，它们朝着林夜和洛清瑶发动了攻击。
林夜和洛清瑶迅速做出反应，与这些神秘生物展开了激烈的战斗。在战斗中，林夜发现这些神秘生物的力量非常强大，而且它们似乎受到某种力量的操控，对林夜和洛清瑶展开了疯狂的攻击。
“这些生物到底是什么？为什么会攻击我们？” 洛清瑶一边躲避着攻击，一边问道。
林夜摇了摇头：“我也不知道，但我感觉它们和初代的阴谋有关。我们必须尽快打败它们，进入时空漩涡，找到答案。”
林夜和洛清瑶相互配合，逐渐占据了上风。在一次激烈的交锋中，林夜发现了神秘生物的弱点。他集中精神，调动体内的星门能量，朝着神秘生物的弱点发动了致命一击。随着一声巨响，神秘生物被击败，倒在地上。
林夜和洛清瑶继续朝着时空漩涡前进，当他们靠近漩涡时，一股强大的吸力将他们吸入了漩涡之中。在漩涡的另一端，等待他们的将是怎样的挑战和秘密呢……
在时空漩涡的拉扯下，林夜和洛清瑶的意识逐渐模糊。当他们再次清醒时，发现自己身处一个奇异的空间。这个空间弥漫着浓厚的迷雾，四周闪烁着神秘的光芒，仿佛隐藏着无数不为人知的秘密。
林夜紧紧握住洛清瑶的手，警惕地观察着周围的环境：“清瑶，这里很危险，我们要小心行事。” 洛清瑶点点头，目光坚定地回应：“好，不管遇到什么，我们都一起面对。”
突然，迷雾中传来一阵低沉的咆哮声，紧接着，一只身形巨大的怪物从迷雾中冲了出来。这只怪物浑身长满了尖锐的鳞片，散发着令人作呕的气息，它的眼睛闪烁着诡异的红光，仿佛来自地狱的恶魔。林夜和洛清瑶迅速摆好战斗姿势，准备迎接怪物的攻击。
怪物张开血盆大口，喷出一股黑色的毒液。林夜和洛清瑶敏捷地跳向一旁，毒液落地瞬间，地面被腐蚀出一个巨大的坑洞。林夜趁怪物攻击的间隙，挥动星纹武装，释放出一道强大的星纹剑气，朝着怪物斩去。怪物察觉到危险，挥动粗壮的爪子，轻易地挡下了林夜的攻击。
就在双方僵持不下时，洛清瑶灵机一动，运用自身独特的能力，干扰怪物的行动。怪物的动作瞬间变得迟缓，林夜抓住机会，再次发动攻击。这一次，他集中全身力量，星纹剑气带着破竹之势，狠狠击中怪物。怪物发出一声痛苦的嘶吼，身体摇摇欲坠。
然而，就在林夜和洛清瑶以为即将战胜怪物时，怪物突然爆发出一股强大的力量，挣脱了洛清瑶的干扰，朝着他们疯狂扑来。林夜和洛清瑶急忙后退，在躲避的过程中，林夜发现怪物的鳞片之间存在一处弱点。
“清瑶，我找到它的弱点了！” 林夜大喊道，“我吸引它的注意力，你找准时机攻击弱点。” 洛清瑶点头示意明白。林夜冲上前去，不断向怪物发动攻击，成功吸引了怪物的全部注意力。洛清瑶则绕到怪物身后，趁怪物不备，释放出一股强大的能量，精准击中怪物的弱点。
随着一声震天动地的巨响，怪物轰然倒地，化作一团黑色的烟雾消散在空气中。林夜和洛清瑶松了一口气，继续朝着空间深处前进。
随着他们深入这个奇异空间，周围的环境变得愈发诡异。地面上出现了许多神秘的符文，墙壁上闪烁着奇异的光芒，仿佛在诉说着一段被遗忘的历史。林夜和洛清瑶小心翼翼地前行，突然，前方出现了一座巨大的石门。石门上刻满了复杂的图案，散发着神秘的气息，仿佛隐藏着解开一切谜团的关键。