在新宇宙重归安宁的岁月里，星桥网络逐渐成为文明交流的命脉。莱娅的世界树在各个星系间播撒生命之种，那些曾被熵能侵蚀的星域重新焕发生机，绽放出奇异的光芒。艾莉丝定期举办跨维度音乐会，不同文明的音律在星桥中交汇，编织成一首首壮丽的宇宙史诗。
然而，零的万象中枢却捕捉到了异常的蛛丝马迹。在宇宙边缘一片被遗忘的星云中，量子沙盘上突然出现了闪烁不定的黑色斑点。“这些波动...与观测者余孽的能量频率不同，但却同样充满了未知的威胁。”她的机械眼快速分析着数据流，发现这些斑点正在以一种诡异的节奏吸收周围的暗物质。
凯洛斯的光暗羽翼不自觉地颤动起来，他感受到一股阴冷的气息正在靠近。当他循着气息探查时，在一颗荒芜的行星表面发现了刻满扭曲符文的黑色石碑。石碑上的符文不断变换，隐隐组成了类似禁忌神纹的图案，却又透着一股陌生的邪恶。“这不是观测者的手笔，”他握紧混沌之枪，“但这些符文似乎在召唤着什么。”
埃文的记忆权杖突然不受控制地发热，记忆火种中浮现出一段模糊的画面：在宇宙诞生之前的混沌中，除了星渊观测者和创世者，还存在着一股蛰伏的神秘力量。那股力量被称为“混沌原核”，它既不追求绝对秩序，也不崇尚自由意志，而是渴望将一切回归到最原始的混沌状态。
维蕾娜在执行巡逻任务时，遭遇了一群外形奇特的生物。它们的身体由流动的暗能量组成，能够随意改变形态，口中念念有词：“秩序已破，混沌当立。”当她试图攻击时，这些生物却化作黑雾消失，只留下一串令人毛骨悚然的笑声。
暗金色种子核心的意识在各个文明间游走，也察觉到了这股暗流。它凝聚成实体，召集了艾莉丝等人：“新的威胁正在逼近，这次的敌人比观测者更加难以捉摸。它们追求的是彻底的混沌，要将所有的规则与文明都碾成齑粉。”
就在此时，宇宙深处传来一阵剧烈的震动。众人抬头望去，只见一片漆黑的云雾正在快速蔓延，所过之处，星辰熄灭，星桥断裂。云雾中传来低沉的轰鸣：“秩序与自由，皆是虚妄。唯有混沌，才是宇宙的终章。”
艾莉丝举起神纹竖琴，琴弦发出激昂的旋律，试图抵挡这股黑暗力量，但却发现音律在接触到黑雾的瞬间就被吞噬。凯洛斯挥舞混沌之枪，三色能量在黑雾中如同泥牛入海，没有激起丝毫波澜。莱娅的世界树根系在黑雾的侵蚀下迅速枯萎，生命之力被疯狂吸收。
零在万象中枢发现了关键线索：“黑雾的核心有一个类似混沌引擎的装置，只要摧毁它，或许就能逆转局势！”她将装置的坐标分享给众人，眼中闪烁着坚定的光芒。
暗金色种子核心的意识体散发出柔和的光芒，融入众人的身体：“我们曾经战胜过绝对秩序，这次也一定能打败混沌的威胁。记住，无论面对怎样的黑暗，文明的火种永远不会熄灭。”
艾莉丝等人握紧武器，向着黑雾的核心飞去。在那里，等待他们的将是比以往更加严峻的挑战，而宇宙的命运，再一次悬于一线......